Следственными органами Следственного комитета России по Республике Башкортостан по материалам налоговых органов по факту уклонения от уплаты налогов руководством ЗАО «Башкирская зерновая торговая компания» в особо крупном размере возбуждено уголовное дело по признакам преступления, предусмотренного ч. п. «б» ч. 2 ст. 199 УК РФ (уклонение от уплаты налогов с организации в особо крупном размере).
По версии следствия, с 2012 по 2013 годы ЗАО «БЗТК» приобретало у организаций и индивидуальных предпринимателей, не являющихся налогоплательщиками НДС зерновое сырье. С целью уклонения от уплаты налогов в бухгалтерских документах эти сделки были учтены как проведенные с организацией, обязанной платить НДС. Мнимые сделки купли-продажи зернового сырья были использованы для завышения суммы налога на добавленную стоимость, подлежащей вычету из бюджета. Указанные незаконные действия руководства общества повлекли неуплату в бюджет налога в сумме свыше 15,6 миллионов рублей.
В настоящее время проводятся следственные действия и оперативно-розыскные мероприятия, направленные на установление всех обстоятельств совершенного преступления, а также лица или лиц из числа руководства торговой компании, причастных к его совершению. Расследование уголовного дела продолжается.